核酸浓度计算(A260)

基于朗伯-比尔定律:A260 = 1 时,dsDNA≈50 ng/µL、ssDNA≈33 ng/µL、RNA≈40 ng/µL。

输入

结果

提示:A260/A280 纯 DNA 约 1.8、纯 RNA 约 2.0~2.2;比值 <1.6 通常提示蛋白/酚残留,<1.5 建议重新抽提。

分子量与拷贝数换算

dsDNA 按 660 Da/bp、ssDNA 330 Da/nt、RNA 340 Da/nt 估算(也可用下方精算公式)。

输入

结果

已知拷贝数 → 质量

精算公式:dsDNA 分子量 ≈ 650×bp(A/T 与 G/C 平均);寡核苷酸分子量 = Σ(单核苷酸残基质量) − 61.96(详见「序列工具箱」)。

引物 Tm 与退火温度

采用 SantaLucia (1998) 最近邻热力学模型,含 Na⁺ 盐浓度与引物浓度校正。

输入

结果

成对评估

建议退火温度(Ta)≈ 最近邻 Tm − 5 °C,梯度 PCR 时可在此值 ±3 °C 范围内摸索。若含 Mg²⁺ 或变性剂,实际 Tm 会升高/降低。

序列工具箱

反向互补、转录、翻译、GC 含量、分子量一次搞定(自动忽略空格/数字/FASTA 头)。

输入序列

统计

序列转换

PCR 反应体系(Master Mix)计算

填写单反应体积,设置反应数与损耗余量,自动给出各组分总量并区分「混合液」与「单独添加」。

组分表

组分单反应(µL)单独添加

配液量(含余量 ×(n+余量))

勾选「单独添加」的组分(如模板、ddH₂O 补水)不计入混合液,按每反应单独移液更准确;混合液配制后按每反应体积分装,最后加入模板。

稀释与溶液配制

三件套:母液稀释(C₁V₁=C₂V₂)、称量配制、系列稀释。

A. 稀释计算 C₁V₁ = C₂V₂

B. 称量配制(摩尔浓度 / 百分比)

C. 系列稀释

细胞计数(血球计数板)

Neubauer 计数板:1 大格 = 1 mm² × 0.1 mm 深 = 1×10⁻⁴ mL,故浓度 = 平均每大格细胞数 × 10⁴ × 稀释倍数。

输入

结果

铺板用量

增殖倍增时间

蛋白浓度(A280)

两种方式:粘贴序列自动算摩尔消光系数,或手动输入 ε / E1%。

A. 蛋白序列(可选)

B. 吸光度换算

结果

ε₂₈₀ 估算:n(Trp)×5500 + n(Tyr)×1490 + n(胱氨酸)×125;A280(1 mg/mL) = ε / MW。若无 Trp/Tyr/Cys,A280 无法用于定量,建议改用 BCA / Bradford。

离心 RPM ↔ RCF 换算

RCF = 1.118×10⁻⁵ × r(cm) × rpm²,r 为转子中心到离心管底/样品中部的半径。

结果

同一 RPM 在不同转子上 RCF 差别很大,记录离心条件时请务必写 ×g。

qPCR 标准曲线与扩增效率

每行填「模板量(拷贝数或相对稀释) , Ct」。斜率 −3.32 ≈ 100% 效率;效率 E = 10^(−1/斜率) − 1。

数据(逗号或空格分隔)

结果

拟合明细

单位换算

质量、体积、摩尔、浓度、长度(含 bp↔nm)常用单位互转。

该类别全部换算

参考速查表

密码子表、氨基酸表、常用缓冲液配方。

标准遗传密码(DNA)

非极性 极性不带电 酸性 碱性 终止 *

氨基酸速查

单字母三字母中文残基质量 (Da)性质

常用缓冲液 / 培养基配方

名称配方(每 1 L)